Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A3Q4VXF1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms