Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYTL3Q4VX76 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYTL3Q4VX76 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms