Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LONRF3Q496Y0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms