Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A52Q3SY17 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms