Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PROX2Q3B8N5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms