Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms