Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETM2Q2VYF4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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