Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms