Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMU1Q2TAY7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms