Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms