Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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