Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms