Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6V1FQ16864 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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