Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA4Q16363 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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