Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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