Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TWIST1Q15672 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms