Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIP4Q15650 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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