Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2LQ15477 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms