Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIX1Q15475 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms