Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR6A1Q15406 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms