Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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