Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCF4Q15080 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms