Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms