Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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UBE4AQ14139 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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