Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CIRBPQ14011 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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