Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASGRF1Q13972 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
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