Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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DDX39BQ13838 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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