Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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