Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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