Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms