Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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