Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
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