Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
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