Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms