Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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MKRN4PQ13434 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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