Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2V1Q13404 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms