Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCGQ13326 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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