Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTGDRQ13258 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDRQ13258 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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