Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1AQ13111 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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