Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms