Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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FOXC1Q12948 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXC1Q12948 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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