Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIAQ12857 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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