Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP1B1Q10567 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP1B1Q10567 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms