Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms