Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IFFO1Q0D2I5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms