Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2H9

GOLGA8DP, Putative golgin subfamily A member 8D, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8DPQ0D2H9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA8DPQ0D2H9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8DPQ0D2H9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms