Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4DQ08499 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms