Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABPAQ06546 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms