Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms