Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms